虽然只是用来喂食动物的，但饲料的安全性也得有所保障，以免危害动物健康。生产安全饲料除了与原料有关之外，与塑料加工机械、加工工艺也是息息相关的。有严格控制加工过程的各个环节，才能生产出安全饲料。

原料方面作为重点要注意的方面比较多，包括有原料的控制和安全贮存、原料的清理、原料中有害组分的控制、配方中各种添加物的控制以及人工添加控制等等。而饲料加工工艺设计和设备的选择，也不是关键换件之一，主要是减少加工过程物料分级和残留，同时利用加工过程中的热处理来消除原料中抗营养因子和有害微生物的影响。
在加工过程中，饲料组分的密度差异、载体颗粒度的不同以及添加剂等微量组分与饲料中的其他用量较大组分之间混合不充分，都是造成分级的重要原因，另外原料的输送、装料和卸料等加工流程也会造成分级，手工操作和加工工艺流程设计不当也易造成分级。
对此，可以通过调整原料的组成和粉碎的粒度来保证原料混合的均匀；对微量组分进行承载，以改变微量组分的混合特性；添加液体组分来增加粉料的粘结；将产品进行制粒或膨化也有助于避免上述现象的发生。